AVR은 내부의 플래쉬 메모리와 EEPROM에 데이터를 써넣을 수 있도록 SPI 인터페이스를 제공한다. SPI는 오직 3라인을 이용한 통신 방법으로 MOSI(Master Out Slave In), MISO(Master In Slave Out), SCLK(SPI CLOCK) 시그널을 이용한다. Motolora에서 개발되었으며 Master와 Slave가 SCLK에 동기하여 데이터를 교환하는 방식이다. 플래쉬 메모리를 억세스 하기 위해서는 AVR의 Reset 핀을 low로 한 상태에서 앞의 세 시그널을 이용하여 데이터를 읽고 쓰기가 가능하다. 즉, AVR과의 SPI 인터페이스를 맞추어주기만 하면 내부 플래쉬 메모리의 억세스가 가능하다는 것이다. 이는 AVR의 프로그래머를 싼 값으로 구현하게 하는 동기가 된다.